Building integrated plant health surveillance: a proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence
S. Soubeyrand
(1)
,
Arnaud Estoup
(2)
,
Astrid Cruaud
(2)
,
Sylvie Malembic-Maher
(3)
,
Christine Meynard
(2)
,
Virginie Ravigné
(4)
,
Marc Barbier
(5)
,
Benoit Barrès
(6)
,
Karine Berthier
(7)
,
Simon Boitard
(2)
,
Sylvie Dallot
(4)
,
Sabrina Gaba
(8)
,
Marie Grosdidier
(1)
,
Mourad Hannachi
(9)
,
Marie-Agnès Jacques
(10)
,
Melen Leclerc
(11)
,
Philippe Lucas
(12)
,
Davide Martinetti
(1)
,
Christophe Mougel
(11)
,
Corinne Robert
(13)
,
Alain Roques
(14)
,
Jean-Pierre Rossi
(2)
,
Frédéric Suffert
(15)
,
Pierre Abad
(16)
,
Marie-Anne Auger-Rozenberg
(14)
,
Jean-Sauveur Ay
(17)
,
Marc Bardin
(7)
,
Hélène Bernard
(18)
,
David Bohan
(19)
,
Thierry Candresse
(3)
,
Philippe Castagnone-Sereno
(16)
,
Etienne Danchin
(20)
,
Chloe E. L. Delmas
(21)
,
Pauline Ezanno
(22)
,
Frédéric Fabre
(21)
,
Benoît Facon
(2)
,
Edith Gabriel
(1)
,
Jonathan Gaudin
(7)
,
Bertrand Gauffre
(23)
,
Mathieu Gautier
(2)
,
Claire Guinat
(24)
,
Claire Lavigne
(23)
,
Olivier Lemaire
(25)
,
César Martinez
(1)
,
Lucie Michel
(1)
,
Benoît Moury
(7)
,
Kiwoong Nam
(26)
,
Claire Nédellec
(27)
,
Mylène Ogliastro
(26)
,
Julien Papaïx
(1)
,
Nicolas Parisey
(11)
,
Sylvain Poggi
(11)
,
Andrea Radici
(1)
,
Jean-Yves Rasplus
(2)
,
Xavier Reboud
(19)
,
Cecile Robin
(28)
,
Mathieu Roche
(29)
,
Adrien Rusch
(21)
,
Nicolas Sauvion
(4)
,
Jean‐Claude Streito
(2)
,
Eric Verdin
(7)
,
Anne-Sophie Walker
(15)
,
Anne Xuéreb
(2)
,
Gaël Thébaud
(4)
,
Cindy E. Morris
(7)
1
BioSP -
Biostatistique et Processus Spatiaux
2 UMR CBGP - Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
3 BFP - Biologie du fruit et pathologie
4 UMR PHIM - Plant Health Institute of Montpellier
5 LISIS - Laboratoire Interdisciplinaire Sciences, Innovations, Sociétés
6 CASPER - CAractérisation et Suivi des Phénomènes d'Evolution de Résistance aux pesticides
7 PV - Unité de Pathologie Végétale
8 CEBC - Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372
9 SADAPT - Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires
10 IRHS - Institut de Recherche en Horticulture et Semences
11 IGEPP - Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes
12 iEES Paris - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
13 ECOSYS - Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes
14 URZF - Zoologie forestière
15 BIOGER - BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture
16 ISA - Institut Sophia Agrobiotech
17 CESAER - Centre d'économie et de sociologie rurales appliquées à l'agriculture et aux espaces ruraux
18 LABERCA - Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
19 Agroécologie [Dijon]
20 INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
21 UMR SAVE - Santé et agroécologie du vignoble
22 BIOEPAR - Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale
23 PSH - Plantes et systèmes de culture horticoles
24 IHAP - Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse]
25 SVQV - Santé de la vigne et qualité du vin
26 DGIMI - Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier]
27 MaIAGE - Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas]
28 BioGeCo - Biodiversité, Gènes & Communautés
29 UMR TETIS - Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale
2 UMR CBGP - Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
3 BFP - Biologie du fruit et pathologie
4 UMR PHIM - Plant Health Institute of Montpellier
5 LISIS - Laboratoire Interdisciplinaire Sciences, Innovations, Sociétés
6 CASPER - CAractérisation et Suivi des Phénomènes d'Evolution de Résistance aux pesticides
7 PV - Unité de Pathologie Végétale
8 CEBC - Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372
9 SADAPT - Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires
10 IRHS - Institut de Recherche en Horticulture et Semences
11 IGEPP - Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes
12 iEES Paris - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
13 ECOSYS - Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes
14 URZF - Zoologie forestière
15 BIOGER - BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture
16 ISA - Institut Sophia Agrobiotech
17 CESAER - Centre d'économie et de sociologie rurales appliquées à l'agriculture et aux espaces ruraux
18 LABERCA - Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
19 Agroécologie [Dijon]
20 INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
21 UMR SAVE - Santé et agroécologie du vignoble
22 BIOEPAR - Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale
23 PSH - Plantes et systèmes de culture horticoles
24 IHAP - Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse]
25 SVQV - Santé de la vigne et qualité du vin
26 DGIMI - Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier]
27 MaIAGE - Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas]
28 BioGeCo - Biodiversité, Gènes & Communautés
29 UMR TETIS - Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale
S. Soubeyrand
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Philippe Lucas
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Davide Martinetti
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Christophe Mougel
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Alain Roques
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Frédéric Suffert
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Marie-Anne Auger-Rozenberg
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Jean-Sauveur Ay
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Marc Bardin
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Hélène Bernard
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David Bohan
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Thierry Candresse
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Philippe Castagnone-Sereno
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Etienne Danchin
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Pauline Ezanno
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Frédéric Fabre
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Benoît Facon
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Sylvain Poggi
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Andrea Radici
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Jean-Yves Rasplus
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Xavier Reboud
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Cecile Robin
- Fonction : Auteur
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Mathieu Roche
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Adrien Rusch
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Nicolas Sauvion
- Fonction : Auteur
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Jean‐Claude Streito
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Eric Verdin
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Anne-Sophie Walker
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Anne Xuéreb
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Gaël Thébaud
- Fonction : Auteur
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Cindy E. Morris
- Fonction : Auteur
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Résumé
In an era marked by rapid global changes, the reinforcement and modernization of plant health surveillance systems have become imperative. Sixty-five scientists present here a research agenda for an enhanced and modernized plant health surveillance to anticipate and mitigate disease and pest emergence. Our approach integrates a wide range of scientific fields (from life, social, physical and engineering sciences) and identifies the key knowledge gaps, focusing on anticipation, risk assessment, early detection, and multi-actor collaboration. The research directions we propose are organized around four complementary thematic axes. The first axis is the anticipation of pest emergence, encompassing innovative forecasting, adaptive potential, and the effects of climatic and cropping system changes. The second axis addresses the use of versatile broad-spectrum surveillance tools, including molecular or imaging diagnostics supported by artificial intelligence, and monitoring generic matrices such as air and water. The third axis focuses on surveillance of known pests from new perspectives, i.e., using novel approaches to detect known species but also anticipating and detecting, within a species, the populations or genotypes that pose a higher risk. The fourth axis advocates the management of plant health as a commons through the establishment of multi-actor and cooperative surveillance systems for long-term data-driven alert systems and information dissemination. We stress the importance of integrating data and information from multiple sources through open science databases and metadata, alongside developing methods for interpolating and extrapolating incomplete data. Finally, we advocate an Integrated Health Surveillance approach in the One Health context, favoring tailored and versatile solutions to plant health problems and recognizing the interconnected risks to the health of plants, humans, animals and the environment, including food insecurity, pesticide residues, environmental pollution and alterations of ecosystem services.
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