Les Drainages Miniers Acides (DMA), causés par l’exploitation minière, entrainent une pollution importante des milieux aquatiques et se caractérisent par la formation d’eaux acides très riches en éléments toxiques. Le Reigous (Gard, France) est un bon exemple de cours d’eau impacté par les DMA, dont les teneurs en fer et arsenic sont des plus élevées au monde. Plusieurs études ont montré que l’activité bactérienne au sein du Reigous entraine rapidement une diminution importante des concentrations en fer et arsenic dans l’eau. La compréhension de ce phénomène d’atténuation naturelle représente donc un enjeu important pour le développement de procédés de traitement des DMA. Dans ce contexte, l’objectif de notre étude est d’améliorer nos connaissances sur l’influence de paramètres biologiques et environnementaux sur la diversité et l’activité des populations bactériennes responsables de l’élimination de l’arsenic et du fer. Pour cela, des expérimentations en laboratoire ont été mises en œuvre dans le but de reproduire ce phénomène d’atténuation naturelle observé sur le terrain. Plusieurs paramètres environnementaux ont été testés tels que la température, le temps de résidence, l’oxygénation ou encore l’apport de matière organique. Nos résultats montrent que les paramètres testés influencent significativement les activités bactériennes d’oxydation du fer et de l’arsenic et par conséquent l’efficacité d’élimination de la pollution dans l’eau. L’augmentation de la température a eu pour effet d’accélérer l’oxydation de l’arsenic (III) et du fer (II) présent dans l’eau alors que l’apport de matière organique a inhibé l’oxydation du fer et entrainé la formation de sédiments riche en arsenic (V). L’analyse de la diversité bactérienne, via le séquençage massif des gènes ADNr 16S, nous a permis d’identifier des populations bactériennes spécifiques en fonction des différents paramètres testés. L’analyse de ces résultats met en évidence un lien fort entre la composition bactérienne et l’efficacité d’élimination du fer et de l’arsenic dans l’eau. En conclusion, les résultats de cette étude ouvrent de nouvelles perspectives de recherche pour le développement d’un traitement biologique des DMA riches en arsenic et en fer, prenant en compte l’influence de paramètres clés (température, nutriments) sur la composition et l’activité des communautés bactériennes.