Second-tier trio exome sequencing after negative solo clinical exome sequencing: an efficient strategy to increase diagnostic yield and decipher molecular bases in undiagnosed developmental disorders - Université de Montpellier Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Human Genetics Année : 2020

Second-tier trio exome sequencing after negative solo clinical exome sequencing: an efficient strategy to increase diagnostic yield and decipher molecular bases in undiagnosed developmental disorders

Frederic Tran Mau-Them
  • Fonction : Auteur
Sebastien Moutton
Caroline Racine
  • Fonction : Auteur
Antonio Vitobello
  • Fonction : Auteur
Ange-Line Bruel
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 822644
Sophie Nambot
  • Fonction : Auteur
Steven Kushner
  • Fonction : Auteur
Femke de Vrij
  • Fonction : Auteur
Daphné Lehalle
  • Fonction : Auteur
Nolwenn Jean-Marçais
  • Fonction : Auteur
François Lecoquierre
Julian Delanne
  • Fonction : Auteur
Julien Thevenon
  • Fonction : Auteur
Charlotte Poe
  • Fonction : Auteur
Thibaut Jouan
  • Fonction : Auteur
Martin Chevarin
  • Fonction : Auteur
David Geneviève
  • Fonction : Auteur
Marjolaine Willems
Christine Coubes
  • Fonction : Auteur
Nada Houcinat
  • Fonction : Auteur
Alice Masurel-Paulet
  • Fonction : Auteur
Anne-Laure Mosca-Boidron
  • Fonction : Auteur
Emilie Tisserant
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 770121
  • IdRef : 159351952
Patrick Callier
Arthur Sorlin
  • Fonction : Auteur
Yannis Duffourd
  • Fonction : Auteur
Laurence Faivre
Christophe Philippe
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 761163
  • IdRef : 083945237
Christel Thauvin-Robinet
  • Fonction : Auteur

Résumé

Developmental disorders (DD), characterized by malformations/dysmorphism and/or intellectual disability, affecting around 3% of worldwide population, are mostly linked to genetic anomalies. Despite clinical exome sequencing (cES) centered on genes involved in human genetic disorders, the majority of patients affected by DD remain undiagnosed after solo-cES. Trio-based strategy is expected to facilitate variant selection thanks to rapid parental segregation. We performed a second step trio-ES (not only focusing on genes involved in human disorders) analysis in 70 patients with negative results after solo-cES. All candidate variants were shared with a MatchMaking exchange system to identify additional patients carrying variants in the same genes and with similar phenotype. In 18/70 patients (26%), we confirmed causal implication of nine OMIM-morbid genes and identified nine new strong candidate genes (eight de novo and one compound heterozygous variants). These nine new candidate genes were validated through the identification of patients with similar phenotype and genotype thanks to data sharing. Moreover, 11 genes harbored variants of unknown significance in 10/70 patients (14%). In DD, a second step trio-based ES analysis appears an efficient strategy in diagnostic and translational research to identify highly candidate genes and improve diagnostic yield.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-03573698 , version 1 (14-02-2022)

Identifiants

Citer

Frederic Tran Mau-Them, Sebastien Moutton, Caroline Racine, Antonio Vitobello, Ange-Line Bruel, et al.. Second-tier trio exome sequencing after negative solo clinical exome sequencing: an efficient strategy to increase diagnostic yield and decipher molecular bases in undiagnosed developmental disorders. Human Genetics, 2020, 139 (11), pp.1381-1390. ⟨10.1007/s00439-020-02178-8⟩. ⟨hal-03573698⟩
24 Consultations
0 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More