Les fluorimètres de terrain de type GGUN (Albillia SARL) permettent de mesurer in situ la fluorescence d’une eau en continu. Ils sont aujourd’hui très largement utilisés pour instrumenter des exutoires karstiques. Dans le cadre d’un traçage artificiel, le GGUN permet de suivre la restitution d’au plus trois traceurs, une optique permet également le suivi de la turbidité. D’après des études récentes, ils permettraient de suivre les variations de Matière Organique Dissoute (MOD) fluorescente, traceur naturel des eaux d’infiltration. D’autre part, la MOD fluorescente et la turbidité, de par leurs variations naturelles, peuvent perturber la mesure de la restitution d’un traceur artificiel. Dans le but de mieux comprendre le fonctionnement du GGUN et d’optimiser le suivi de la fluorescence naturelle et artificielle aux émergences karstiques, des fluorimètres ont été installés au niveau de deux exutoires karstiques appartenant au SO karst (http ://www.sokarst.org/) à la source du Lez depuis avril 2010 et à la Fontaine de Nîmes depuis juin 2012. Parallèlement à ce suivi in situ, un suivi régulier (bimensuel à journalier en crue) de la fluorescence naturelle par spectrofluorimétrie 3D a été réalisé pour le suivi de la MOD fluorescente à la source du Lez, complété par quelques prélèvements ponctuels à la Fontaine de Nîmes. La comparaison de ces deux types de suivis démontre qu’il est possible de suivre en continu les variations des différents composés de la MOD aux deux émergences karstiques. Ces résultats permettent également de mieux comprendre la dynamique des signaux d’origine naturelle mesurés par les optiques du GGUN. Ainsi, dans le cas d’une restitution de traceur artificiel influencée par l’évolution du bruit de fond, il devient possible de simuler précisément le signal qui aurait été mesuré en l’absence de traceur pour s’affranchir de son influence sur la courbe de restitution.