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3D genome reconstruction from chromosomal contacts

Annick Lesne , Julien Riposo , Paul Roger , Axel Cournac , Julien Mozziconacci
Nature Methods, 2014, 11, pp.1141-1143. ⟨10.1038/NMETH.3104⟩
Article dans une revue hal-02324120v1
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Kinetic Signature of Cooperativity in the Irreversible Collapse of a Polymer

Vittore F Scolari , Guillaume Mercy , Romain Koszul , Annick Lesne , Julien Mozziconacci
Physical Review Letters, 2018, 121 (5), pp.057801. ⟨10.1103/PhysRevLett.121.057801⟩
Article dans une revue hal-01992814v1
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Condensin- and Replication-Mediated Bacterial Chromosome Folding and Origin Condensation Revealed by Hi-C and Super-resolution Imaging.

Martial Marbouty , Antoine Le gall , Diego I Cattoni , Axel Cournac , Alan Koh , et al.
Molecular Cell, 2015, 59 (4), pp.588-602. ⟨10.1016/j.molcel.2015.07.020⟩
Article dans une revue pasteur-01419993v1
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Perspectives on Chromosome Organization

Marcelo Nollmann , Romain Koszul
Journal of Molecular Biology, 2020, 432 (3), pp.635-637. ⟨10.1016/j.jmb.2019.12.021⟩
Article dans une revue pasteur-02868093v1
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Chromosomal scale assembly of parasitic wasp genome reveals symbiotic virus colonization

Jérémy Gauthier , Hélène Boulain , Joke J F A van Vugt , Lyam Baudry , Emma Persyn , et al.
Communications Biology, 2021, 4 (1), pp.1-15. ⟨10.1038/s42003-020-01623-8⟩
Article dans une revue hal-03127732v1
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Rapport de conjoncture 2019 : CID 51 Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant

Franck Picard , Myriam Ferro , Alice Cleynen , Marie Doumic , Xavier Duchemin , et al.
Comité national de la recherche scientifique. 2020
Rapport hal-04360199v1
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Chromosomal resolution reveals symbiotic virus colonization of parasitic wasp genomes

Jérémy Gauthier , Hélène Boulain , Joke J.F.A. van Vugt , Lyam Baudry , Emma Persyn , et al.
2020
Pré-publication, Document de travail hal-03090838v1
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Author Correction: Chromosomal scale assembly of parasitic wasp genome reveals symbiotic virus colonization

Jérémy Gauthier , Hélène Boulain , Joke J F A van Vugt , Lyam Baudry , Emma Persyn , et al.
Communications Biology, 2021, 4, ⟨10.1038/s42003-021-02480-9⟩
Article dans une revue hal-04686846v1
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Chromosome-level genome assembly reveals homologous chromosomes and recombination in asexual rotifer Adineta vaga

Paul Simion , Jitendra Narayan , Antoine Houtain , Alessandro Derzelle , Lyam Baudry , et al.
Science Advances , 2021, 7 (41), pp.eabg4216. ⟨10.1126/sciadv.abg4216⟩
Article dans une revue hal-03406292v1
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Crosstalk between Hepatitis B Virus and the 3D Genome Structure

João Diogo Dias , Nazim Sarica , Axel Cournac , Romain Koszul , Christine Neuveut
Viruses, 2022, 14 (2), pp.445. ⟨10.3390/v14020445⟩
Article dans une revue pasteur-03689314v1