The predictive ability of the 313 variant–based polygenic risk score for contralateral breast cancer risk prediction in women of European ancestry with a heterozygous BRCA1 or BRCA2 pathogenic variant
Inge Lakeman
,
Alexandra van den Broek
,
Juliën Vos
,
Daniel Barnes
,
Julian Adlard
(1, 2)
,
Irene Andrulis
(3)
,
Adalgeir Arason
(4)
,
Norbert Arnold
(5)
,
Banu Arun
(6)
,
Judith Balmaña
(7)
,
Daniel Barrowdale
(8)
,
Javier Benitez
(9, 10)
,
Ake Borg
(11)
,
Trinidad Caldés
(12)
,
Maria Caligo
(13)
,
Wendy Chung
(14)
,
Kathleen Claes
(15)
,
J Margriet Collée
(16)
,
Fergus Couch
(17)
,
Mary Daly
(18)
,
Joe Dennis
,
Mallika Dhawan
,
Susan Domchek
,
Ros Eeles
,
Christoph Engel
,
D Gareth Evans
,
Lidia Feliubadaló
,
Lenka Foretova
,
Eitan Friedman
,
Debra Frost
,
Patricia Ganz
,
Judy Garber
,
Simon Gayther
,
Anne-Marie Gerdes
,
Andrew Godwin
,
David Goldgar
,
Eric Hahnen
,
Christopher Hake
,
Ute Hamann
,
Frans Hogervorst
,
Maartje Hooning
,
John Hopper
,
Peter Hulick
,
Evgeny Imyanitov
,
Claudine Isaacs
,
Louise Izatt
,
Anna Jakubowska
,
Paul James
,
Ramunas Janavicius
,
Uffe Birk Jensen
,
Yue Jiao
(19, 20)
,
Esther John
,
Vijai Joseph
,
Beth Karlan
,
Carolien Kets
,
Irene Konstantopoulou
,
Ava Kwong
,
Clémentine Legrand
(21)
,
Goska Leslie
,
Fabienne Lesueur
(19, 20)
,
Jennifer Loud
,
Jan Lubiński
,
Siranoush Manoukian
,
Lesley Mcguffog
,
Austin Miller
,
Denise Molina Gomes
(22)
,
Marco Montagna
,
Emmanuelle Mouret-Fourme
(19)
,
Katherine Nathanson
,
Susan Neuhausen
,
Heli Nevanlinna
,
Joanne Ngeow Yuen Yie
,
Edith Olah
,
Olufunmilayo Olopade
,
Sue Park
,
Michael Parsons
,
Paolo Peterlongo
,
Marion Piedmonte
,
Paolo Radice
,
Johanna Rantala
,
Gad Rennert
,
Harvey Risch
,
Rita Schmutzler
,
Priyanka Sharma
,
Jacques Simard
,
Christian Singer
,
Zsofia Stadler
,
Dominique Stoppa-Lyonnet
(19, 23)
,
Christian Sutter
,
Yen Yen Tan
,
Manuel Teixeira
,
Soo Hwang Teo
,
Alex Teulé
,
Mads Thomassen
,
Darcy Thull
,
Marc Tischkowitz
,
Amanda Toland
,
Nadine Tung
,
Elizabeth van Rensburg
,
Ana Vega
,
Barbara Wappenschmidt
,
Peter Devilee
,
Christi van Asperen
,
Jonine Bernstein
,
Kenneth Offit
,
Douglas Easton
,
Matti Rookus
,
Georgia Chenevix-Trench
,
Antonis Antoniou
,
Mark Robson
,
Marjanka Schmidt
,
Kathleen B.M. Claes
,
Emmanuelle Barouk-Simonet
,
Muriel Belotti
,
Pascaline Berthet
,
Yves-Jean Bignon
,
Valérie Bonadona
,
Brigitte Bressac-de Paillerets
,
Bruno Buecher
,
Sandrine Caputo
,
Olivier Caron
,
Laurent Castera
,
Virginie Caux-Moncoutier
,
Chrystelle Colas
,
Marie-Agnès Collonge-Rame
,
Isabelle Coupier
,
Antoine de Pauw
,
Capucine Delnatte
,
Camille Elan
,
Laurence Faivre
,
Sandra Fert Ferrer
,
Marion Gauthier-Villars
,
Paul Gesta
,
Sophie Giraud
,
Lisa Golmard
,
Claude Houdayer
,
Christine Lasset
,
Maïté Laurent
,
Dominique Leroux
,
Michel Longy
,
Véronique Mari
,
Sylvie Mazoyer
,
Noura Mebirouk
,
Isabelle Mortemousque
,
Fabienne Prieur
,
Pascal Pujol
(24, 25)
,
Claire Saule
,
Helene Schuster
,
Nicolas Sevenet
,
Hagay Sobol
,
Johanna Sokolowska
,
Laurence Venat-Bouvet
,
Munaza Ahmed
,
Julian Barwell
,
Angela Brady
,
Paul Brennan
,
Carole Brewer
,
Jackie Cook
,
Rosemarie Davidson
,
Alan Donaldson
,
Alison Dunning
,
Jacqueline Eason
,
Diana Eccles
,
Helen Gregory
,
Helen Hanson
,
Patricia Harrington
,
Alex Henderson
,
Shirley Hodgson
,
M. John Kennedy
,
Fiona Lalloo
,
Clare Miller
,
Patrick Morrison
,
Kai-Ren Ong
,
Aoife O’shaughnessy-Kirwan
,
Jo Perkins
,
Mary Porteous
,
Mark Rogers
,
Lucy Side
,
Katie Snape
,
Lisa Walker
,
Gord Glendon
,
Anna Marie Mulligan
,
Cora Aalfs
,
Muriel Adank
,
Margreet G.E.M. Ausems
,
Marinus Blok
,
Encarna Gómez Garcia
,
Bernadette A.M. Heemskerk-Gerritsen
,
Antoinette Hollestelle
,
Agnes Jager
,
Linetta Koppert
,
Marco Koudijs
,
Mieke Kriege
,
Hanne E.J. Meijers-Heijboer
,
Arjen Mensenkamp
,
Thea Mooij
,
Jan Oosterwijk
,
Ans M.W. van den Ouweland
,
Frederieke van Der Baan
,
Annemieke van Der Hout
,
Lizet van Der Kolk
,
Rob van Der Luijt
,
Carolien H.M. van Deurzen
,
Helena van Doorn
,
Klaartje van Engelen
,
Liselotte van Hest
,
Theo A.M. van Os
,
Senno Verhoef
,
Maartje Vogel
,
Juul Wijnen
,
Jonathan Beesley
,
Stephen Fox
,
Helene Holland
,
Kelly-Anne Phillips
,
Amanda Spurdle
1
Chapel Allerton Hospital
2 University of Leeds
3 Departments of Molecular Genetics and Laboratory Medicine and Pathobiology
4 Reykjavík University
5 Division of Oncology, Department of Gynaecology and Obstetrics
6 The University of Texas M.D. Anderson Cancer Center [Houston]
7 Unitat d'Alt Risc i Prevenció del Càncer
8 CAM - University of Cambridge [UK]
9 Group of Human Genetics, Human Cancer Genetics Programme
10 Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Raras (CIBERER)
11 Department of Oncology, Clinical Sciences
12 IdISSC - Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Clínico San Carlos [Madrid, Spain]
13 Section of Genetic Oncology
14 Columbia University [New York]
15 Ghent University Hospital
16 Department of Clinical Genetics
17 Department of Laboratory Medicine and Pathology
18 Division of Population Science
19 Institut Curie [Paris]
20 Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris)
21 CHUGA - Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble]
22 CHI Poissy-Saint-Germain
23 U830 - Unité de génétique et biologie des cancers
24 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
25 MIVEGEC - Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle
2 University of Leeds
3 Departments of Molecular Genetics and Laboratory Medicine and Pathobiology
4 Reykjavík University
5 Division of Oncology, Department of Gynaecology and Obstetrics
6 The University of Texas M.D. Anderson Cancer Center [Houston]
7 Unitat d'Alt Risc i Prevenció del Càncer
8 CAM - University of Cambridge [UK]
9 Group of Human Genetics, Human Cancer Genetics Programme
10 Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Raras (CIBERER)
11 Department of Oncology, Clinical Sciences
12 IdISSC - Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Clínico San Carlos [Madrid, Spain]
13 Section of Genetic Oncology
14 Columbia University [New York]
15 Ghent University Hospital
16 Department of Clinical Genetics
17 Department of Laboratory Medicine and Pathology
18 Division of Population Science
19 Institut Curie [Paris]
20 Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris)
21 CHUGA - Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble]
22 CHI Poissy-Saint-Germain
23 U830 - Unité de génétique et biologie des cancers
24 CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier]
25 MIVEGEC - Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle
Inge Lakeman
- Fonction : Auteur
Alexandra van den Broek
- Fonction : Auteur
Juliën Vos
- Fonction : Auteur
Daniel Barnes
- Fonction : Auteur
- PersonId : 768315
- ORCID : 0000-0002-3781-7570
Irene Andrulis
- Fonction : Auteur
- PersonId : 806569
- ORCID : 0000-0002-4226-6435
Daniel Barrowdale
- Fonction : Auteur
- PersonId : 768869
- ORCID : 0000-0003-1661-3939
Trinidad Caldés
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762555
- ORCID : 0000-0002-1038-5392
Wendy Chung
- Fonction : Auteur
- PersonId : 786377
- ORCID : 0000-0003-3438-5685
Kathleen Claes
- Fonction : Auteur
- PersonId : 791343
- ORCID : 0000-0003-0841-7372
Joe Dennis
- Fonction : Auteur
- PersonId : 791341
- ORCID : 0000-0003-4591-1214
Mallika Dhawan
- Fonction : Auteur
Susan Domchek
- Fonction : Auteur
Ros Eeles
- Fonction : Auteur
Christoph Engel
- Fonction : Auteur
D Gareth Evans
- Fonction : Auteur
Lidia Feliubadaló
- Fonction : Auteur
Lenka Foretova
- Fonction : Auteur
Eitan Friedman
- Fonction : Auteur
Debra Frost
- Fonction : Auteur
Patricia Ganz
- Fonction : Auteur
Judy Garber
- Fonction : Auteur
Simon Gayther
- Fonction : Auteur
- PersonId : 825708
- ORCID : 0000-0001-7937-5443
Anne-Marie Gerdes
- Fonction : Auteur
Andrew Godwin
- Fonction : Auteur
David Goldgar
- Fonction : Auteur
Eric Hahnen
- Fonction : Auteur
Christopher Hake
- Fonction : Auteur
Ute Hamann
- Fonction : Auteur
Frans Hogervorst
- Fonction : Auteur
Maartje Hooning
- Fonction : Auteur
John Hopper
- Fonction : Auteur
Peter Hulick
- Fonction : Auteur
- PersonId : 791345
- ORCID : 0000-0001-8397-4078
Evgeny Imyanitov
- Fonction : Auteur
Claudine Isaacs
- Fonction : Auteur
Louise Izatt
- Fonction : Auteur
Anna Jakubowska
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762556
- ORCID : 0000-0002-5650-0501
Paul James
- Fonction : Auteur
- PersonId : 791346
- ORCID : 0000-0002-4361-4657
Ramunas Janavicius
- Fonction : Auteur
Uffe Birk Jensen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 765276
- ORCID : 0000-0002-6205-6355
Esther John
- Fonction : Auteur
Vijai Joseph
- Fonction : Auteur
Beth Karlan
- Fonction : Auteur
Carolien Kets
- Fonction : Auteur
Irene Konstantopoulou
- Fonction : Auteur
Ava Kwong
- Fonction : Auteur
Goska Leslie
- Fonction : Auteur
- PersonId : 791342
- ORCID : 0000-0001-5756-6222
Fabienne Lesueur
- Fonction : Auteur
- PersonId : 766610
- ORCID : 0000-0001-7404-4549
- IdRef : 165329939
Jennifer Loud
- Fonction : Auteur
Jan Lubiński
- Fonction : Auteur
Siranoush Manoukian
- Fonction : Auteur
Lesley Mcguffog
- Fonction : Auteur
Austin Miller
- Fonction : Auteur
- PersonId : 798123
- ORCID : 0000-0001-9739-8462
Marco Montagna
- Fonction : Auteur
Katherine Nathanson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 806570
- ORCID : 0000-0002-6740-0901
Susan Neuhausen
- Fonction : Auteur
Heli Nevanlinna
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762552
- ORCID : 0000-0002-0916-2976
Joanne Ngeow Yuen Yie
- Fonction : Auteur
Edith Olah
- Fonction : Auteur
Olufunmilayo Olopade
- Fonction : Auteur
- PersonId : 806571
- ORCID : 0000-0002-9936-1599
Sue Park
- Fonction : Auteur
- PersonId : 806572
- ORCID : 0000-0001-5002-9707
Michael Parsons
- Fonction : Auteur
- PersonId : 797799
- ORCID : 0000-0003-3242-8477
Paolo Peterlongo
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762723
- ORCID : 0000-0001-6951-6855
Marion Piedmonte
- Fonction : Auteur
Paolo Radice
- Fonction : Auteur
- PersonId : 763238
- ORCID : 0000-0001-6298-4111
Johanna Rantala
- Fonction : Auteur
Gad Rennert
- Fonction : Auteur
- PersonId : 766345
- ORCID : 0000-0002-8512-068X
Harvey Risch
- Fonction : Auteur
Rita Schmutzler
- Fonction : Auteur
Priyanka Sharma
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757755
- ORCID : 0000-0003-3890-3590
Jacques Simard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757778
- ORCID : 0000-0001-6906-3390
Christian Singer
- Fonction : Auteur
Zsofia Stadler
- Fonction : Auteur
Dominique Stoppa-Lyonnet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 770393
- ORCID : 0000-0002-5438-8309
- IdRef : 050298550
Christian Sutter
- Fonction : Auteur
Yen Yen Tan
- Fonction : Auteur
Manuel Teixeira
- Fonction : Auteur
Soo Hwang Teo
- Fonction : Auteur
Alex Teulé
- Fonction : Auteur
Mads Thomassen
- Fonction : Auteur
Darcy Thull
- Fonction : Auteur
Marc Tischkowitz
- Fonction : Auteur
Amanda Toland
- Fonction : Auteur
- PersonId : 806574
- ORCID : 0000-0002-0271-1792
Nadine Tung
- Fonction : Auteur
Elizabeth van Rensburg
- Fonction : Auteur
Ana Vega
- Fonction : Auteur
- PersonId : 763402
- ORCID : 0000-0002-7416-5137
Barbara Wappenschmidt
- Fonction : Auteur
Peter Devilee
- Fonction : Auteur
- PersonId : 763377
- ORCID : 0000-0002-8023-2009
- IdRef : 074428608
Christi van Asperen
- Fonction : Auteur
Jonine Bernstein
- Fonction : Auteur
Kenneth Offit
- Fonction : Auteur
Douglas Easton
- Fonction : Auteur
- PersonId : 782295
- ORCID : 0000-0003-2444-3247
Matti Rookus
- Fonction : Auteur
Georgia Chenevix-Trench
- Fonction : Auteur
Antonis Antoniou
- Fonction : Auteur
Mark Robson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 795764
- ORCID : 0000-0002-3109-1692
Marjanka Schmidt
- Fonction : Auteur
- PersonId : 795763
- ORCID : 0000-0002-2228-429X
Kathleen B.M. Claes
- Fonction : Auteur
Emmanuelle Barouk-Simonet
- Fonction : Collaborateur
Muriel Belotti
- Fonction : Collaborateur
Pascaline Berthet
- Fonction : Collaborateur
Yves-Jean Bignon
- Fonction : Collaborateur
Valérie Bonadona
- Fonction : Collaborateur
Brigitte Bressac-de Paillerets
- Fonction : Collaborateur
Bruno Buecher
- Fonction : Collaborateur
Sandrine Caputo
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 756410
- ORCID : 0000-0001-5338-9388
- IdRef : 111394759
Olivier Caron
- Fonction : Collaborateur
Laurent Castera
- Fonction : Collaborateur
Virginie Caux-Moncoutier
- Fonction : Collaborateur
Chrystelle Colas
- Fonction : Collaborateur
Marie-Agnès Collonge-Rame
- Fonction : Collaborateur
Isabelle Coupier
- Fonction : Collaborateur
Antoine de Pauw
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 766347
- ORCID : 0000-0003-3898-073X
Capucine Delnatte
- Fonction : Collaborateur
Camille Elan
- Fonction : Collaborateur
Laurence Faivre
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 757929
- ORCID : 0000-0001-9770-444X
Sandra Fert Ferrer
- Fonction : Collaborateur
Marion Gauthier-Villars
- Fonction : Collaborateur
Paul Gesta
- Fonction : Collaborateur
Sophie Giraud
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 1359982
- ORCID : 0000-0003-1243-3084
Lisa Golmard
- Fonction : Collaborateur
Claude Houdayer
- Fonction : Collaborateur
Christine Lasset
- Fonction : Collaborateur
Maïté Laurent
- Fonction : Collaborateur
Dominique Leroux
- Fonction : Collaborateur
Michel Longy
- Fonction : Collaborateur
Véronique Mari
- Fonction : Collaborateur
Sylvie Mazoyer
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 752568
- IdHAL : sylvie-mazoyer
- ORCID : 0000-0002-2135-0160
- IdRef : 075600390
Noura Mebirouk
- Fonction : Collaborateur
Isabelle Mortemousque
- Fonction : Collaborateur
Fabienne Prieur
- Fonction : Collaborateur
Pascal Pujol
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 756985
- ORCID : 0000-0001-8315-4715
Claire Saule
- Fonction : Collaborateur
Helene Schuster
- Fonction : Collaborateur
Nicolas Sevenet
- Fonction : Collaborateur
Hagay Sobol
- Fonction : Collaborateur
Johanna Sokolowska
- Fonction : Collaborateur
Laurence Venat-Bouvet
- Fonction : Collaborateur
Munaza Ahmed
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Paul Brennan
- Fonction : Collaborateur
Carole Brewer
- Fonction : Collaborateur
Jackie Cook
- Fonction : Collaborateur
Rosemarie Davidson
- Fonction : Collaborateur
Alan Donaldson
- Fonction : Collaborateur
Alison Dunning
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 797107
- ORCID : 0000-0001-6651-7166
Jacqueline Eason
- Fonction : Collaborateur
Diana Eccles
- Fonction : Collaborateur
Helen Gregory
- Fonction : Collaborateur
Helen Hanson
- Fonction : Collaborateur
Patricia Harrington
- Fonction : Collaborateur
Alex Henderson
- Fonction : Collaborateur
Shirley Hodgson
- Fonction : Collaborateur
M. John Kennedy
- Fonction : Collaborateur
Fiona Lalloo
- Fonction : Collaborateur
Clare Miller
- Fonction : Collaborateur
Patrick Morrison
- Fonction : Collaborateur
Kai-Ren Ong
- Fonction : Collaborateur
Aoife O’shaughnessy-Kirwan
- Fonction : Collaborateur
Jo Perkins
- Fonction : Collaborateur
Mary Porteous
- Fonction : Collaborateur
Mark Rogers
- Fonction : Collaborateur
Lucy Side
- Fonction : Collaborateur
Katie Snape
- Fonction : Collaborateur
Lisa Walker
- Fonction : Collaborateur
Gord Glendon
- Fonction : Collaborateur
Anna Marie Mulligan
- Fonction : Collaborateur
Cora Aalfs
- Fonction : Collaborateur
Muriel Adank
- Fonction : Collaborateur
Margreet G.E.M. Ausems
- Fonction : Collaborateur
Marinus Blok
- Fonction : Collaborateur
Encarna Gómez Garcia
- Fonction : Collaborateur
Bernadette A.M. Heemskerk-Gerritsen
- Fonction : Collaborateur
Antoinette Hollestelle
- Fonction : Collaborateur
- PersonId : 762554
- ORCID : 0000-0003-1166-1966
Agnes Jager
- Fonction : Collaborateur
Linetta Koppert
- Fonction : Collaborateur
Marco Koudijs
- Fonction : Collaborateur
Mieke Kriege
- Fonction : Collaborateur
Hanne E.J. Meijers-Heijboer
- Fonction : Collaborateur
Arjen Mensenkamp
- Fonction : Collaborateur
Thea Mooij
- Fonction : Collaborateur
Jan Oosterwijk
- Fonction : Collaborateur
Ans M.W. van den Ouweland
- Fonction : Collaborateur
Frederieke van Der Baan
- Fonction : Collaborateur
Annemieke van Der Hout
- Fonction : Collaborateur
Lizet van Der Kolk
- Fonction : Collaborateur
Rob van Der Luijt
- Fonction : Collaborateur
Carolien H.M. van Deurzen
- Fonction : Collaborateur
Helena van Doorn
- Fonction : Collaborateur
Klaartje van Engelen
- Fonction : Collaborateur
Liselotte van Hest
- Fonction : Collaborateur
Theo A.M. van Os
- Fonction : Collaborateur
Senno Verhoef
- Fonction : Collaborateur
Maartje Vogel
- Fonction : Collaborateur
Juul Wijnen
- Fonction : Collaborateur
Jonathan Beesley
- Fonction : Collaborateur
Stephen Fox
- Fonction : Collaborateur
Helene Holland
- Fonction : Collaborateur
Kelly-Anne Phillips
- Fonction : Collaborateur
Amanda Spurdle
- Fonction : Collaborateur
Résumé
Purpose: To evaluate the association between a previously published 313 variant-based breast cancer (BC) polygenic risk score (PRS313) and contralateral breast cancer (CBC) risk, in BRCA1 and BRCA2 pathogenic variant heterozygotes.
Methods: We included women of European ancestry with a prevalent first primary invasive BC (BRCA1 = 6,591 with 1,402 prevalent CBC cases; BRCA2 = 4,208 with 647 prevalent CBC cases) from the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2 (CIMBA), a large international retrospective series. Cox regression analysis was performed to assess the association between overall and ER-specific PRS313 and CBC risk.
Results: For BRCA1 heterozygotes the estrogen receptor (ER)-negative PRS313 showed the largest association with CBC risk, hazard ratio (HR) per SD = 1.12, 95% confidence interval (CI) (1.06-1.18), C-index = 0.53; for BRCA2 heterozygotes, this was the ER-positive PRS313, HR = 1.15, 95% CI (1.07-1.25), C-index = 0.57. Adjusting for family history, age at diagnosis, treatment, or pathological characteristics for the first BC did not change association effect sizes. For women developing first BC < age 40 years, the cumulative PRS313 5th and 95th percentile 10-year CBC risks were 22% and 32% for BRCA1 and 13% and 23% for BRCA2 heterozygotes, respectively.
Conclusion: The PRS313 can be used to refine individual CBC risks for BRCA1/2 heterozygotes of European ancestry, however the PRS313 needs to be considered in the context of a multifactorial risk model to evaluate whether it might influence clinical decision-making.
Domaines
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