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HAL TEI export of hal-02002263 CCSD CC0 1.0 - Universal

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Molecular characterization of Orf virus in goats in Gabon, Central Africa Gael Maganga 1235672-0 Anthony Relmy 850804-0 Labib Bakkali-Kassimi 3b5ccb9a64616e47e28f820b0cc6a364 anses.fr labib-bakkali-kassimi 1201657 1512266-1201657 https://orcid.org/0000-0002-6677-6819 Barthélémy Ngoubangoye 763466 621635-763466 https://orcid.org/0000-0002-0868-3868 https://www.idref.fr/219903921 Thierry Tsoumbou 1512267-0 Christiane Bouchier 44b9ee95aca22c88b25d62e7bd587b91 pasteur.fr 911184 148403-911184 https://orcid.org/0000-0003-3549-1543 Nadine N’dilimabaka 1512268-0 Djébé M'Baïri 200626-0 Stéphan Zientara ab187aa4bf2be4a370fdc1d92154b4d9 anses.fr stephan-zientara 748557 2291123-748557 https://www.idref.fr/07674745X https://orcid.org/0000-0002-6733-8503 szientara https://viaf.org/viaf/172178050 Nicolas Berthet a005a608eb606ddca96d14e455e95bca pasteur.fr nicolas-berthet 751043 444800-751043 https://orcid.org/0000-0002-6369-7138 HAL Mivegec 667df89f39e007eb155382763ca6c827 ird.fr 2019-01-31 15:36:13 2026-05-12 17:02:03 2019-01-31 16:56:25 2016 2019-01-31 contributor HAL Mivegec 667df89f39e007eb155382763ca6c827 ird.fr CCSD hal-02002263 https://hal.umontpellier.fr/hal-02002263 maganga:hal-02002263 <i>Virology Journal</i>, 2016, 13, pp.79. <a target="_blank" href="https://dx.doi.org/10.1186/s12985-016-0535-1">⟨10.1186/s12985-016-0535-1⟩</a> Virology Journal, 2016, 13, pp.79. ⟨10.1186/s12985-016-0535-1⟩ HAL Authorization IRD - Institut de recherche pour le développement Institut Pasteur Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail Université Denis Diderot - Paris VII HAL-Francophonie, Afrique et océan indien CNRS - Centre national de la recherche scientifique Institut Pasteur de Paris Agropolis Université Sorbonne Paris Cité Archive ouverte en agrobiosciences Biologie, Ecologie, Evolution, Environnement, Sciences de la Terre et de l'Eau Université de Montpellier Université Paris Cité Université Paris Cité - Faculté des Sciences Université de Montpellier (2015-2021) Epidémiologie et Physiopathologie des Virus Oncogènes / Oncogenic Virus Epidemiology and Pathophysiology Virologie Université des Sciences et Techniques de Masuku France Génomique Biomics International No Yes Molecular characterization of Orf virus in goats in Gabon, Central Africa Gael Maganga 1235672-0 Anthony Relmy 850804-0 Labib Bakkali-Kassimi 3b5ccb9a64616e47e28f820b0cc6a364 anses.fr labib-bakkali-kassimi 1201657 1512266-1201657 https://orcid.org/0000-0002-6677-6819 Barthélémy Ngoubangoye 763466 621635-763466 https://orcid.org/0000-0002-0868-3868 https://www.idref.fr/219903921 Thierry Tsoumbou 1512267-0 Christiane Bouchier 44b9ee95aca22c88b25d62e7bd587b91 pasteur.fr 911184 148403-911184 https://orcid.org/0000-0003-3549-1543 Nadine N’dilimabaka 1512268-0 Djébé M'Baïri 200626-0 Stéphan Zientara ab187aa4bf2be4a370fdc1d92154b4d9 anses.fr stephan-zientara 748557 2291123-748557 https://www.idref.fr/07674745X https://orcid.org/0000-0002-6733-8503 szientara https://viaf.org/viaf/172178050 Nicolas Berthet a005a608eb606ddca96d14e455e95bca pasteur.fr nicolas-berthet 751043 444800-751043 https://orcid.org/0000-0002-6369-7138 2506 1743-422X Virology Journal BioMed Central 13 79 2016 2016-05-13 10.1186/s12985-016-0535-1 English High-throughput sequencing PCR Goats Orf virus High-throughput sequencing Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology Journal articles Journal articles Journal articles

Background: Orf or contagious ecthyma is a zoonotic viral infection with a potential serious health threat for the small ruminants industry as well as humans. It is currently emerging in new territories.Results: Eight suspected clinical cases of pustular dermatitis in goats occurred in the rural area of Tebe, in south-eastern Gabon, in January 2013. The orf virus (ORFV) was detected by high-throughput sequencing on sera, buccal swabs and scab pool samples. It was confirmed in six out of eight sick goats by using specific PCR targeting the major envelope protein (B2L) and the orf virus interferon resistance (VIR) genes. Phylogenetic analysis revealed that the Gabonese strain and South Korean strains evolved from a common ancestor, suggesting an Asian origin of the ORFV’ Gabonese strain.Conclusions: This study provides the molecular detection of the ORFV strain involved in the cases of pustular dermatitis in goats and highlights its circulation in Gabon

Institut National Supérieur d'Agronomie et de Biotechnologie INSAB

Franceville

http://www.univ-masuku.org/institut-d-agronomie-insab/ 148269761 0000 0001 0584 7022 https://ror.org/0471kz689 Q392520 Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail ANSES 2010-07-01

14 rue Pierre et Marie Curie94701 MAISONS-ALFORT Cedex

https://ror.org/01wyqb997 Centre International de Recherches Médicales de Franceville CIRMF

Franceville, Gabon

Génomique (Plate-Forme) - Genomics Platform 2019-01-01

Pôle BIOMICS, CITECH28 rue du Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15

https://research.pasteur.fr/en/team/genomics/ 166407313 0000000403823424 201119437J https://ror.org/00357kh21 Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle MIVEGEC 2021-12-31

911 Avenue Agropolis BP 64501 34394 Montpellier cedex 5

https://mivegec.fr/ 235568643 200118187U Epidémiologie et Physiopathologie des Virus Oncogènes EPVO (UMR_3569 / U-Pasteur_3) 2019-12-31

Département de Virologie, 25-28 rue du Docteur Roux F-75724 Paris Cedex 15

https://research.pasteur.fr/en/team/oncogenic-virus-epidemiology-and-pathophysiology/ Université des Sciences et Techniques de Masuku USTM

Franceville

http://www.univ-masuku.ga/ 027936643 0000 0001 2353 6535 https://ror.org/0495fxg12 Institut Pasteur [Paris] IP 1887-06-04

25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15

https://www.pasteur.fr 0000000120970141 https://ror.org/051escj72 Université de Montpellier UM 2021-12-31

163 rue Auguste Broussonnet - 34090 Montpellier

http://www.umontpellier.fr/ 02636817X 0000000122597504 https://ror.org/02feahw73 Centre National de la Recherche Scientifique CNRS 1939-10-19

https://www.cnrs.fr/ Institut de Recherche pour le Développement - délégation Occitanie IRD [Occitanie]

911 avenue Agropolis,BP 6450134394 Montpellier cedex 5

https://occitanie.ird.fr/ 050165224 https://ror.org/05q3vnk25 Institut de Recherche pour le Développement IRD

SiègeLe Sextant 44, bd de DunkerqueCS 9000913572 Marseille cedex 02

http://www.ird.fr/ 027542084 0000000121514068 https://ror.org/02n7qrg46 Université Paris Diderot - Paris 7 UPD7 2019-12-31

5 rue Thomas-Mann - 75205 Paris cedex 13

http://www.univ-paris-diderot.fr