Toxines et Signalisation -Toxins and Signalling Renewed taxonomy : phylogeny and species delimitation in an integrative framework
Résumé
The vast diversity of species included in the genus Conus and in the superfamily Conoidea make them one of the most promising taxa for the discovery of new toxin-derived drugs. To rationalize the search for new peptides, integrative taxonomy can be used to quickly identify new lineages that potentially evolved new toxins. In this context, molecular characters are now a major tool, whether for specimen identification ("barcoding"), species delimitation (alpha-taxonomy) or phylogeny. At the species level, different criteria have been successfully applied to analyze DNA sequences and propose hypotheses of species delimitation in the genus Benthomangelia that are supported by other characters such as morphology. At the phylogenetic level, molecular characters were also used to define highly divergent lineages within Conoidea and to infer their relationships. The methodology used, based on clearly stated concepts and integrating different criteria and characters allow the definition of robust, reproducible and testable hypotheses. Furthermore, discriminating these lineages (families, subfamilies, genera or species) is of great value in toxin research, as illustrated with the family Terebridae where three different lineages have been identified each of them susceptible to have evolved their own set of toxins. Le renouveau de la taxonomie : phylogénie et délimitation d'espèces dans un contexte intégratif La grande diversité spécifique inclue dans le genre Conus et dans la superfamille des Conoidea font de ces groupes certains des plus prometteurs pour la découverte de nouvelles thérapies dérivées de toxines. Pour rationaliser la recherche de nouveaux peptides, une approche de taxonomie intégrative peut permettre d'identifier rapidement des lignées évolutives qui auraient potentiellement développé de nouvelles toxines. Dans ce contexte, les caractères moléculaires sont devenus un outil majeur, que ce soit pour l'identification de spécimens (« barcoding »), la délimitation d'espèces (alpha-taxonomie) et la phylogénie. Au niveau spécifique, différents critères ont été appliqués avec succès pour analyser des séquences ADN et proposer des hypothèses de délimitation d'espèces au sein du genre Benthomangelia, hypothèses soutenues par d'autres caractères (morphologiques). Au niveau phylogénétique, les caractères moléculaires ont été également utilisés pour définir différentes lignées au sein des Conoidea. La méthodologie utilisée, basée sur des concepts clairement établis et intégrant différents critères et caractères, permet de proposer des hypothèses robustes, reproductibles et testables. De plus, discriminer ces lignées (familles, sous-familles, genres et espèces) est important pour la recherche de toxines, comme le montre l'analyse de la famille des Terebridae, où trois différentes lignées ont été identifiées, chacune susceptible d'avoir développé des toxines uniques.
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